Si necesita acceder a su base de datos desde fuera, típicamente con un programa, necesita acceder usando la IP de su servido y desde el puerto 3306 (puerto por defecto de mysql)
Importante: Para que su máquina tenga acceso a su base de datos remotamente debe agregar la IP de su máquina o si es una IP dinámica (la mayoría de los casos) agregar el simbolo % (permitir todos) en host, para esa base de datos en la sección [Control de MySQL] , click en la base de datos, en la sección Access Hosts, en su panel de control DirectAdmin.